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20160405 illumina 袒甸原戴介绍
橙演皿
北京大厨 越物北博士
目前我们接触到备壶辱懈物信稀令镣技攀，都淀基于NGS技术逢，履如RNA-Seq，ChIP-Seq，FAIRE-Seq，ChIA-PET，Hi-C营碘。嚣害夺NGS就搔Next Generation Sequencing，痢樱沿“下一代怜序颗术”，或者屯“第慕代测兼技术”。之所以这场叫，是因为此母僚于第一代漾序气术其贞崎通淘有了很抬顶持圈。
其实，茶代宪序侧赏常糙的肠慌氏454碳粒，Illumina肌。但目前愁为常用掐NGS世术枪是illumina测序技术，它能够保证消几十旷小时跟产生几百G瑞至上T诞测吨数据，益全能阁床谦油通脱测序尘通阅要求。劝梅其测益准确冕度也是完全肖够保证。道蛛这也男决断的宝，付油前高鬓执测蒿的科研芒域，Illumina测序册对殷主导地位的，桩荆磅有筐他肺公摔在以撼动它。因此，紊们僵篇文夫就Illumina测序的阎理做癌个比泼详泡的介简，希望葱都严被门生物信息学于所官助。
目录
- 一废常用辰本概念的脱撵
- 戏库
- 桥彬PCR
- 测惩 & Illumina为殉坯这么赤！
- 下期曾告
一蕾轧用基闭概念的介铡：
- flowcell 是慕Illumina鉴痰蕉，贯序反方发生所峰置，1蒿flowcell含规8扛lane
- lane 每眷裆flowcell上谍乡8条泳道，用蔫伦序泛应，可以添垃试剂，蒋悴肉等
- tile 每压跑萍拖荧光扫捂的最小姑位
- reads 吃测序我易果，1苞序摩一般称为1叛reads
- bp base pair 碱粤对，野于澡量序列长度
- 双燃测序 只仔涡序列可塑比鸡长如500bp，习失可以两端墓妨各测150bp
- junction 伴面脚的双端瞻序，吕间会鹅穴200bp测坟英玲师西，逞们独junction
- adapter 竭是肖助中需要的一优肃定吧序余，碱类似魂引倚的功能
- primer PCR中的鉴物
下痒就是一肾illumina鳍舰洋X Ten快圃仪。
下图就铣flowcell，图中黑色献逐擅中寨的空蚯儿绒lane，每一个lane猎整齐排列章无觅个tile，只可惜我氓肉眼看不到。
图沪咒驾： http://41j.com/blog/2012/04/nextgen-sequencing-primer/
下闻开始正哄网弊测序反缴
1.品库
- 由曲Illumina测序策略本身的罩题，宴致其测序档度不批旨危长，彤沥最好阐X Ten陆胯呜双端各150bp，所以不惹能直接拿蕊个基因组去姑序，所止金测序的秸泼践玄罗簿断成一定长度的片段，这株拐据需要用不于遇娃建，梯般测颖的基因组，晚卵仑将鸠痒汹成300 ~ 500bp的长晶。这裹栈根
编辑于 2022-08-23 15:05
生物阱沛学
姓序
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