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1996年淮宿分治，原淮阴市两名九三社员陆续调入宿迁工作，2003年9月16日，宿迁共有九三社员8名，九三学社宿迁支社经九三江苏省委苏社字【2003】42号文批准成立，隶属于九三学社江苏省委，2003年9月26日召开支社成立大会。2004年6月社员发展到36名,中共宿迁市委同意成立九三学社宿迁市委筹委会和主任委员建议人选。2005年7月，共有社员44人，支社的组织规模和社员素质均达到了成立市委的要求，宿迁市委统战部报请省委统战部批准同意成立九三学社宿迁市委筹委会，2005年8月18日省委统战部下文同意成立九三学社宿迁市委员会筹委会，任命陈菊兰同志为主任委员，肖大松、张旭为委员。2005年11月2日，社省委九三苏发【2005】53号文批复同意成立四个支社及支社领导班子人选，要求按有关规定做好选举工作。2005年11月8日，召开筹委会成立大会。2007年6月25日九三学社宿迁市委员会召开成立大会（暨第一次代表大会），共有社员70名，曹成同志当选主任委员，肖大松、张旭当选副主任委员。2011年12月22日上午，九三学社宿迁市委员会召开第二次代表大会，参会代表60人，武倩同志当选主任委员，张旭、陆红梅当选副主任委员。截至2012年4月，九三学社宿迁市委员会共有四个支社，五个专门委员会，社员129人，平均年龄39岁，全部为本科以上学历，高、中级职称，其中，博士、硕士研究生31人，占24%，高级职称51人，占40%，市政协副主席1人，县处级领导6人，省政协委员1人，市、区人大代表、政协委员18名，市政协常委4人。均年龄39岁。