1991年6月，对大塞尔维亚主义感到极度不安的斯洛文尼亚共和国经10天的小规模陆战达成独立（史称十日战争）、接下来马其顿宣布独立、和塞尔维亚长期不睦的克罗地亚也宣布独立。

这期间并未引起米洛舍维奇控制的南斯拉夫人民军（已经由塞尔维亚人控制）的激烈干预，毕竟这几个国家里的塞尔维亚人很少。

其实这已经超出了内战的范畴，各共和国都已经对联盟失去了信心，他们所做的无非是为自己的民族多挣一块地盘。

大规模的战争是从波黑宣布独立开始，波黑国内的塞尔维亚人要自波黑独立，引来了塞尔维亚的介入。

此外塞尔维亚国内的科索沃自治州也意图独立最后和塞尔维亚引发科索沃战争。

后来北约和美国介入，战事逐渐平缓下来。

战争中引发的人道主义灾难引起了世界各国人民的愤怒，其中波黑战争中的种族清洗最为惨烈。

战争中近两万名穆斯林妇女被关进集中营任由士兵侮辱，这等于是要了她们的命，尽管在许多妇女怀孕生下小孩后被释放，但她们不能再回到原来的家了。

而这些残暴的士兵有塞尔维亚的人民军，也有雇佣军（来自欧洲的刑事犯、冒险家和政治赌徒）。

其中一位西方臭名昭著的黑社会老大就被任命为校官，制造了多起骇人听闻的屠杀。

多年后，一位塞尔维亚官员解释说，在巴尔干半岛过去的战争传统中，胜利者有权砍下俘虏的人头，当时的士兵已经很克制了，毕竟没办法在上战场前普及日内瓦公约。

当然战争罪行绝不是塞尔维亚一族犯下的，穆斯林抓到塞尔维亚族士兵，都要对他们强行施割礼，目的是破坏对方的民族身份。